本季主要讲述是2110年，地球能源接近枯竭，环境污染日趋严重，为解决地球能源危机，人类制造赛尔机器人，建造宇宙能源探索飞船赛尔号。宇宙探索任重而道远，肩负在宇宙中寻找无尽能源与新能源探索伟大使命，赛尔们向宇宙进发，但就在找到无尽能源时，无尽能源被宇宙海盗摧毁，赛尔们不得不去寻找藏在宇宙深处，由传说中圣灵系王者谱尼看守第二个无尽能源……而300年前，谱尼曾经在宇宙深渊救起过迷失宇宙海盗艾里逊，艾里逊最后为当四当家背叛谱尼，与迪恩带大批宇宙海盗设计圈套抓住谱尼，并将其封印300年……于是从那时起，谱尼无比憎恨机器人立志复仇。